To by samo o sobě nemuselo vadit (pokud v tom není nějaký spešl firmware - což se mi nezdá moc pravděpodobné). Měl jsem v ruce několik disků, které odmítaly bootovat (spíš se to týkalo WXP), kde se nekorektně založila aktivní partition.

Zkusil bych, pokud je to nějaký menší disk, pustit Ranish partition manager, vše, co tam je, odstranit, vytvořit malou partition na zkušební systém, nastavit korektně MBR, odstranit věci, které tam byly zaznamenány předtím a mělo by to jít.