já mám desku na G35 + ICH9R, na ní pověšenej WD5000AAKS a dělalo mi to to, co tobě. pravděpodobně je to chyba v HD Tune. když je disk v IDE-compatible modu, tak HD Tune to bere jako ATA-100 disk, ale dokáže z něj vytáhnout SMART. když je disk v AHCI módu, HD Tune z něho nevytáhne nic.
zkus se na to mrknout třeba v Everestu, ten mi to ukázal korektně v obou případech.
btw ten ovladač pro SATA-AHCI disky je ovladač k jižnímu můstku chipsetu, nLitem naintegrovat do instalačky a jedeš.