Já vždy při instalaci nastavím všem partition (kromě té, na kterou půjde systém) příznak HIDDEN. Instalátor je nevidí a přidělí správně písmenko C. Po nainstalování windows jim příznak odeberu.

Prý lze změnit písmenko i systémové partition, ale je třeba opravit všechny cesty v registrech, a na to bych si netroufal. Chvíli jsem googlil, ale bez výsledku. Radši to přeinstaluj.