Mel jsem podobny problem u brachy. Koupil jsem mu novy disk a Windows zacly bejt strasne pomaly (respektive nikdy nedobootovaly). A tusim (uz si to moc nepamatuju) ne hned, ale az po par restartech, asi chvilku trvalo, nez se pomrsil driver.
Bylo to tim, ze disk byl ATA66 a to radic na desce a BIOS nezvladaly.

Nastesti to byl Asus, takze i na tak starou desku jeste meli update BIOSu, s opravenou podporu ATA66, tak jsem flashnul a byl a je klid.

Tusim (uz fakt nevim presne), ze pomahalo, kdyz jsem vypnul DMA pristup, nebo pripojit nejaky pomaly CD na stejnou ksandu, nebo co jsem s tim zkousel za psi kusy.

Jestli nenajdes update BIOSu, tak me jeste napada pridavnej ATA66 radic, ale z toho Win98 nenabootujou.