Ad disky:
AFAIK všechny poslední Samsungy jsou extrémně hlučné hlavně při rozbíhání, to zní jako rozbitá převodovka... Když si nastavíš delší sleep time na Synology, mělo by to být lepší pro uši i pro životnost disků.

Ad poštovní účty:
Není mi jasné co přesně chceš dosáhnout, ale vidím dvě možnosti. Buď si nastavíš na stanicích Thunderbird tak, aby stahovanou poštu neodstraňoval ze serveru a pak to bude fungovat přesně jak říkáš. Navíc se ke kompletní poště dostaneš kdekoliv i z netu. Nebo se na Synology dá v jejich supportu najít balíček, který funguje IMHO jako poštovní server (nezkoušel jsem), takže si Synology bude stahovat poštu z lib. účtů lokálně a pak budeš přistupovat na poštu pouze k Synology.