chtít to říct lidsky, tak asi takto:
bug je chyba aplikace/programu/kódu zadaná to trackeru/helpdesku
issue často bývá i "chyba" mezi židlí a klávesnící zadaná do helpdesku
z softwarů které hledáš se dá doporučit např. ClearQuest či ClearCase z portfolia Rational od IBM