Problém vyřešen.

Prohodil jsem řadič ze slotu PCI3 do posledního PCI6. A nyní jedou oba řadiče v pohodě. Už jsem myslel, že 2x Promise nerozchodím. BXMaster je excellent deska

Dále jsem zjistil, že v BIOSu jde nastavit priorita pořadí řadičů - jmenuje se to tam divně boot priority UATA/SCSI (UATA je integrovaný řadič a SCSI je řadič do PCI v mém případě SATAII).