Jasně, jdou všechny.
Pokud instaluješ záplaty ručně, tak parameter /nobackup zajistí, že se ten adresář ani nevytvoří.
Pro oba případy platí, že poté nejde hotfix/servicepack odinstalovat.
Další úspora místa je (pokud systém běží jak má) vypnout body obnovení (tím se všechny body vymažou) a znovu jej zapnout (popř. nechat vypnutý, ale tím přijdeš o možnost vrátit se zpět po reinstalaci ovladačů/některých programů).