Zkus si stáhnout Ranish partition manager (link: http://www.ranish.com/part/part240.zip ) a nakopíruj jeho soubory na instalační disketu win98 (nebo winXP). Kdyby se to tam nevlezlo, smaž z ní všechny soubory kromě io.sys, msdos.sys a command.com. Pak nabootuj z diskety a program spusť příkazem part.exe. Kurzorovými šipkami najeď na jednotlivé partition a pomocí klávesy DELETE je smaž. Pak najeď na Master boot record a koukni se vpravo dole, zda tam nemáš náhodou napsáno Unknown IPL. Pokud ano, pomocí ENTERu vybereš nějakou volbu (myslím je tam nejvhodnější Standard IPL). Pomocí F2 to uložíš. Pak jen najedeš kurzorovými šipkami na neobsazené místo, přes ENTER vytvoříš partition FAT32 o velikosti, jakou potřebuješ. Stisknutím klávesy B ji označíš jako bootovací (na tom řádku s partition je pak "zobáček"). F2 uložit a restartovat. Pak zkus znovu instalovat systém.
Mně se windows 98 kdysi chovaly stejně a tato úprava pomohla.