Stačí přidat do resource souboru něco ve stylu
(C style resource; u C# jsem resource zatím nijak nezkoumal)
1 24 "Mujprogram.exe.Manifest"

Nebo docela dobře se to dělá v Resource Hackeru...otevřeš si exáč a dáš add new resource z menu Action. Vybereš manifest a jako resource type dáš 24 a jako name dáš 1, language necháš prázdn. Add resource a uložit