Zatím jsem to nepotřeboval, takže střílím naslepo.
edquota -p vzor -g grupa nefunguje ? Máš na tom oddíle povolenou group quotu ?

EDIT: jinak pokud nechceš používat grup quotu a chceš nastavení replikovat jen na usery ve větším množství, tak by se na to musel udělat skript.