Ta volba v BIOSu znamená, že USB flash disky - ATAPI
Removable Media Device (ARMD) se v systému budou hlásit jako floppy disk nebo harddisk. Je to dobré třeba v linuxu, že si člověk může namontovat jako HDD ten flash disk.

mount -t vfat /dev/sda /mnt/usb

Více zde:
http://www.linuxjournal.com/article.php?sid=6867

Jinak k tvému problému, podle mě musí daná hra podporovat USB josticky (USB HID), možná existuje patch, mrkni se do readme.txt ke hře.
Nebo zkus se podívat na netu co k tvému josticku píšou a jestli na něj jsou speciální drivery...