I při připojení fyzického disku/partition dělá VMWare .vdmk soubor a ukládá do něj informace o té partition a práva přístupu.
Při vytváření nové VM dej ten adresář s .vmdk na parititon na kterou umí hostitelský OS zapisovat. Pokud tedy spouštíš VMWare z Windows, tak jej umísti na nějakou partition s FAT nebo NTFS. Pak už dále pokračuj stejně jako jsi to dělal a mělo by to jet.