Teď jsem to řešil taky. Pokud chceš mít systém na S-ATA disku na raidu musíš dát windowsům ovladače právě na ten raid. Při najíždění instalace stiskneš F6 a dáš tam disketu s ovladačemi na sata raid (stáhneš na ofic stránkách).
Nebo nastavit v biosu first boot jako sata.