Zkus nejdřív věci, které se dají udělat bez problému, tj. BIOS. Aby to s tím kondíkem mohlo fungovat, musel by se nejdřív nabít a pak dodat ten náboj do fanu. Jenže jestli je tam rovnou malý napětí, tak není čím ho nabít a na stejnou velikost to nemá význam. Kdyby tam totiž bylo při bootu těch 12V jak tam má být, nepotřeboval bys žádnej kondík, motor by dostal plné napětí a rozběhl by se. Potom může napětí spadnout, ale to už se točí a do určitého poklesu se udrží v běhu. Další možnost, dej tam místo pevného odporu potenciometr s maximální hodnotou jakou má ten termistor při pokojové teplotě. Pak to můžeš ovládat, jak budeš potřebovat. Jediná podmínka je, nastavit v BIOSu normální režim, žádný vychytávky.
Já osobně bych to nechal na tom termistoru, maximálně ho vyměnit za ten potenciometr a nastavit na rozumné otáčky, tak aby se spolehlivě rozbíhal.