Pokud při klonování použije Acronis 2011 tak ten už podporuje zarovnávání - sám jsem přecházel z klasického disku na Intel SSD a neměl jsem problém. Samozřejmě doporučuju SATA>(e)SATA, přes USB je to pomalá sebevražda (hodně malých souborů přes usb = záruka několikahodinového kopírování)